Załącznik 2b

 

Wykaz prac opublikowanych w 2000 roku
przez pracowników Katedry Metod Komputerowych UMK

 

 

A. Oryginalne prace opublikowane w czasopismach recenzowanych o zasięgu międzynarodowym.

 

1.       Duch W.
Similarity based methods: a general framework for classification, approximation and association,
Control and Cybernetics 29(4) (2000) pp. 1-30

2.       Duch W.
Neural networks papers on the Internet.
IEEE Transactions on Neural Networks 11 (2000) 1509-1511

3.       Duch W,
Therapeutic applications of computer models of brain activity for Alzheimer disease.
J. Medical Informatics and Technologies 5 (2000) 27-34

4.       Duch W, Adamczak R, Diercksen G.H.F.
Classification, Association and Pattern Completion using Neural Similarity Based Methods.
Applied Mathematics and Computer Science 10(4) (2000) 101-120

5.       Duch W, Adamczak R, Diercksen G.H.F.
Neural Networks from Similarity Based Perspective.
New Frontiers in Computational Intelligence and its Applications. Ed. M. Mohammadian, IOS Press, Amsterdam, pp. 93-108

6.       Duch W, Adamczak R, Grąbczewski K, Jankowski N.
Neural methods of knowledge extraction.
Control and Cybernetics 29, No. 4 (2000), pp. 31-50

7.       Duch W, Grąbczewski K, Jankowski N, Adamczak R
Optimization and interpretation of rule-based classifiers, 
Advances in Soft Computing, Physica Verlag (Springer), pp. 1-13

8.       Duch W, Hayashi Y,
Computational intelligence methods and data understanding.
Springer studies in fuzziness and soft computing 54 (2000), pp. 256-270

9.       Frary A, Nesbitt T.C, Frary A, Grandillo S, van der Knaap E, Cong B, Liu J, Meller J, Elber R, Alpert K.B, Tanksley S.D.,
fw2.2: A Quantitative Trait Locus Key to the Evolution of Tomato Fruit Size.
Science 289 (2000) 85-88

10.   Wan J, Meller J, Hada M, Ehara M, Nakatsuji H,
Electronic excitation spectra of furan and pyrrole: Revisited by the symmetry adapted cluster-configuration interaction method.
Journal of Chemical Physics (2000) 113: 7853-7866

11.   Zhao W, M. Asscher, M. Wilde, K. Al.-Shamery, H.-J. Freund, V. Staemmler, M. Wierzbowska.
Interaction and diffusion of potassium on Cr2O3(0001)/Cr(110).
Phys. Rev. B  62 (2000) 7527-7534

12.   Zelek S, Wasilewski J, Heldt J,
Density functional study of the S0 (X 1Ag) and T1 (a 3Au) states of the glyoxal molecule.
Computers & Chemistry 24 (2000) 263-274

 

 

A’. Oryginalne prace opublikowane w czasopismach recenzowanych o zasięgu krajowym.

 

1.       Duch W,
Świadomość i dynamiczne modele działania mózgu.
Neurologia i Neurochirurgia Polska, Maj 2000, pp. 69-84

2.       Duch W,
Jaka teoria umysłu w pełni nas zadowoli?
Kognitywistyka i Media w Edukacji 3 (2000) 29-53

3.       Duch W,
Debata: Sztuczny mózg, sztuczna inteligencja.
Kognitywistyka i Media w Edukacji 3 (2000) 95-98

4.       Adamczak R, Duch W,
Model FSM w zastosowaniu do klasyfikacji.
Biocybernetyka 2000, Tom 6: Sieci neuronowe (red. W. Duch, J. Korbicz, L. Rutkowski i R. Tadeusiewicz), rozdz. III.26, pp. 801-824

5.       Chojnowski A, Duch W
Analiza szeregów czasowych obrazów.
Biocybernetyka 2000, Tom 6: Sieci neuronowe (red. W. Duch, J. Korbicz, L. Rutkowski i R. Tadeusiewicz), rozdz. II.17, pp. 569-588

6.       Duch W
Sieci neuronowe w modelowaniu zaburzeń neuropsychologicznych i chorób psychicznych.
Biocybernetyka 2000, Tom 6: Sieci neuronowe (red. W. Duch, J. Korbicz, L. Rutkowski i R. Tadeusiewicz), rozdz. II.18, pp. 589-616

7.       Duch W, Grudziński K
Sieci Neuronowe i Uczenie Maszynowe: próba integracji.
Biocybernetyka 2000, Tom 6: Sieci neuronowe (red. W. Duch, J. Korbicz, L. Rutkowski i R. Tadeusiewicz), rozdz. III.21, pp. 663-690

8.       Grąbczewski K, Duch W, Adamczak R
Neuronowe metody odkrywania wiedzy w danych.
Biocybernetyka 2000, Tom 6: Sieci neuronowe (red. W. Duch, J. Korbicz, L. Rutkowski i R. Tadeusiewicz), rozdz. III.20, pp. 637-662

9.       Jankowski N, Duch W
Ontogeniczne sieci neuronowe.
Biocybernetyka 2000, Tom 6: Sieci neuronowe (red. W. Duch, J. Korbicz, L. Rutkowski i R. Tadeusiewicz), rozdz. I.8, pp. 257-294

 

Książki

1.       Duch W, Korbicz J, Rutkowski L, Tadeusiewicz R, red. (2000)
Biocybernetyka 2000: Sieci neuronowe.
(Akademicka Oficyna Wydawnicza, Warszawa, 850 str.)



 

 

B. Publikacje z międzynarodowych konferencji naukowych: recenzowane prace zwyczajne.

 

1.       Adamczak R and Duch W
Neural networks for structure-activity relationship problems. W: L. Rutkowski, R. Tadeusiewicz, eds, Neural Networks and Soft Computing, Zakopane, June 2000, pp. 669-674

2.       Duch W, Adamczak R, Hayashi Y
Neural eliminators and classifiers,
ICONIP-2000, 7th International Conference on Neural Information Processing, Nov. 2000, Dae-jong, Korea, ed. by Soo-Young Lee, pp. 1029 – 1034

3.       Duch W, Adamczak R, Diercksen GHF
Feature space mapping neural network applied to structure-activity relationship problems.
ICONIP-2000, 7th International Conference on Neural Information Processing, Nov. 2000, Dae-jong, Korea, ed. by Soo-Young Lee, pp. 270 – 274

4.       Duch W, Adamczak R, Grąbczewski K, Grudzinski K, Jankowski N, Naud N.
Understanding the data: extraction, optimization and  interpretation of logical rules.
ICONIP-2000, 7th International Conference on Neural Information Processing, Nov. 2000, Dae-jong, Korea, str. 53 (materiały tutorialu)

5.       Duch W, Adamczak R, Grąbczewski K, Grudzinski K, Jankowski N, Naud N.
Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods.
ICONIP-2000, 7th International Conference on Neural Information Processing, Nov. 2000, Dae-jong, Korea, str. 70 (materiały tutorialu)

6.       Duch W, Grudziński K, Stawski G
Symbolic features in neural networks. W: L. Rutkowski, R. Tadeusiewicz, eds, Neural Networks and Soft Computing, Zakopane, June 2000, pp. 180-185

7.       Duch W, Jankowski N.
Taxonomy of neural transfer functions,
International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN) 2000, Vol. III, pp. 477-484

8.       Grąbczewski K and Duch W,
The separability of split value criterion. W: L. Rutkowski, R. Tadeusiewicz, eds, Neural Networks and Soft Computing, Zakopane, June 2000, pp. 201-208

9.       Grudziński K, Duch W,
SBL-PM: A Simple Algorithm for Selection of Reference Instances for Similarity Based Methods,
Intelligent Information Systems IIS'2000, Physica Verlag (Springer) 2000, pp. 99-108

10.   Jankowski N,
Data regularization.
W: L. Rutkowski, R. Tadeusiewicz, eds, Neural Networks and Soft Computing, Zakopane, Poland, June 2000, pp. 209-214

11.   Jankowski N,
Probabilistic intervals of confidence.
W: L. Rutkowski and R. Tadeusiewicz, editors, Neural Networks and Soft Computing, Zakopane, Poland, June 2000, pp. 215-220

12.   Jankowski N, Gomuła J
Simultaneous differential diagnoses basing on MMPI inventory using neural networks and decision trees methods. In L. Bobrowski, J. Doroszewski, E. Marubini, and N. Victor, editors, Statistics and Clinical Practice, Warsaw, Poland, June 2000, pp. 89-95

13.   Naud A and Duch W,
Interactive data exploration using MDS mapping. W: L. Rutkowski, R. Tadeusiewicz, eds, Neural Networks and Soft Computing, Zakopane, June 2000, pp. 255-260

14.   Naud A and Duch W,
Exploration interactive de données par "Multidimensional scaling". W: Actes des 10emes Journées Neurosciences et sciences de l'Ingénieur - NSI'2000, pp. 89-92, 11-14.09.2000, Dinard, France.

 

Publikacje nierecenzowane: preprinty, referaty dostępne w sieci

1.       Duch W,
Book review: Statistics and Neural Networks: Advances at the Interface. J.W. Kay and D.M. Titterington (eds.). IEEE Transactions on Neural Networks 11 (6), 2000, 1508-1509

2.       Duch W, Naud A,
Book review: Faithful representations and topographic maps, by Marc M. van Hulle.
IEEE Transactions on Neural Networks Vol. 11 (No. 6), 2000, 1508-1508

3.       Duch W, Wykłady wstępne o komputerach i oprogramowaniu, Studium Podyplomowe.
http://www.fizyka.umk.pl/~duch/Wyklady/index.htm

4.       Duch W,
Wstęp do kognitywistyki (wykład monograficzny).
http://www.fizyka.umk.pl/~duch/Wyklady/index.htm

5.       Duch W, Mózg, umysł i zachowanie (wykład monograficzny). http://www.fizyka.umk.pl/~duch/Wyklady/index.htm

6.       Duch W, Sztuczna inteligencja (wykład monograficzny). http://www.fizyka.umk.pl/~duch/Wyklady/index.htm

7.       Duch W, Inteligencja obliczeniowa (wykład monograficzny). http://www.fizyka.umk.pl/~duch/Wyklady/index.htm

8.       Duch W, uzupełnienie WWW do książek: Fascynujący świat komputerów i Fascynujący świat programów komputerowych. http://www.fizyka.umk.pl/~duch/book-fsk.html

9.       Duch W, Understanding the data: extraction, optimization and interpretation of logical rules. Referat, w RIKEN, Wako-shi, 28.04.2000, http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

10.   Duch W, How does the brain work? Talk given at the University of Tokyo, 14.04.2000,   http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

11.   Duch W, Therapeutic Implications of Computer Models of Brain Activity for Alzheimer Disease. Invited talk, Medical Informatics & Technologies, Ustroń, Poland, 8-10.11.2000
http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

12.   Duch W, Computational intelligence methods and data understanding.Invited talk, Euro-International Symposium on Computational Intelligence, Kosice, Slovakia, 30.08-1.09.2000.
http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

13.   Duch W, Extraction of Knowledge from Data Using Computational Intelligence Methods. 4-hour tutorial to be presented at The International Joint Conference on Neural Networks, Como, Italy, 24-27 July 2000.  http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

14.   Duch W, Neurophilosophical solution to the hard problem of consciousness. Talk given at the University of Konstanz, Germany, 20.07.2000. http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

15.   Duch W, Czy umysł może zrozumieć sam siebie? Uwagi o percepcji muzyki. Referat na Koncercie Orkiestry Kameralnej, Toruń 20.05.2000, http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

16.   Duch W, Świadomość i dynamiczne modele działania mózgu.
Szkoła PTBUN (Polskie Towarzystwo Badań Układu Nerwowego), 5.05.2000. http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

17.   Duch W, Czy można zbudować świadomy komputer? Inst. Fizyki, IF UMK, 9.03.2000. http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

18.   Duch W, Koncepcja duszy i umysłu w świetle neurobiologii. Seminarium kognitywne, UMK, 2.03.2000, http://www.fizyka.umk.pl/~duch/ref.html

19.   Duch W, Cyberprzyszłość naprawdę fantastyczna. Zahcon 2000, Konwent Miłośników Fantastyki, Toruń, 7.10.2000

20.   Duch W, Sztuczny mózg? Sztuczna inteligencja? Dyskusja o postępach na drodze do sztucznej inteligencji, 3 Festiwal Nauki, Wrocław, 23.09.2000.

21.   Meller J, Elber R. (2000) LOOPP 2.0 - Learning, Observing and Outputting Protein Patterns, a public domain package for protein recognition and designing folding potentials, część zasobów National Institute of Health, USA, oraz serwer “Web protein prediction”, Cornell Theory Center, http://www.tc.cornell.edu/CBIO/loopp/

 

Prace w druku

1.      Duch W,
Publikacje naukowe o sieciach neuronowych w Internecie.
EBIB, Elektroniczny Biuletyn Informacyjny Bibliotekarzy 1 (2001) 19

2.       Duch W,
Neurokognitywna teoria świadomości.
Sympozium Kognitywne, Obrzycko, Maj 2000

3.       Duch W, Adamczak R, Grąbczewski K,
Methodology of extraction, optimization and application of crisp and fuzzy logical rules.
IEEE Transactions on Neural Networks (marzec 2001)

4.       Duch W, Adamczak R, Diercksen GHF,
Constructive density estimation network based on several different separable transfer functions. 9th European Symposium on Artificial Neural Networks, Bruges, Belgium 2001

5.       Duch W, Grudziński K
Ensembles of Similarity-Based Models.
Intelligent Information Systems, Zakopane, June 2001

6.       Duch W, Grudzinski K, Adamczak R, Grabczewski K. and Jankowski N.
Prototype based rules - new way to understand the data.
International Joint Conference on Neural Networks, Washington D.C. 2001

7.       Duch W, Korczak J,
Optimization and global minimization methods suitable for neural networks, Neural Computing Surveys (in revision)

8.       Jankowski N, Duch W,
Optimal transfer function neural networks.
9th European Symposium on Artificial Neural Networks, Bruges, Belgium, April 2001

9.       Meller J,
Molecular Dynamics.
Encyclopedia of Life Sciences, Macmillan Reference Ltd (w druku)

10.   Meller J, Malrieu J.P, Heully J.L,
Size-consistent multireference CI method through the dressing of the norm of determinants, Journal of Chemical Physics (w druku)

 

 

 

C. Prace wysłane do druku

 

1.       Duch W
Neurokognitywna teoria świadomości,
Cognitive symposium, Obrzycko, May 2000

2.       Meller J, Elber R.
Towards large scale, statistically significant, threading experiments (wysłane)

3.       Meller J, Elber R,
Linear Programming Optimization and a Double Statistical Filter for Protein Threading Protcols, Proteins Structure Fun. Gen. (wyslane 2000)

4.       Meller J, Elber R,
Protein recognition by sequence-to-structure fitness: Bridging efficiency and capacity of threading potentials,
Advances of Chemical Physics  (wysłane 2000)

5.       Turowski M, Yamakawa N, Meller J, Kimata K, Ikegami T, Hosoya K, Tanaka N, Thornton R, Isotope effect on the hydrophobic interactions. Dispersion forces driven binding of protiated and deuterated compounds to non-polar organic moieties.
J. of American Chemical Society (wysłane)

6.       Jankowski K., Rubiniec K., Wasilewski J.,
Coupled cluster energy dependence of reference-state choice: impact of cluster operator structure.
Chem. Phys. Letters (2000) - wysłana

 

D. Artykuły popularno-naukowe i inne

 

1.       Duch W (2000) "W 2050 - nieśmiertelność !!!". Wywiad dla Gazety Toruńskiej 30.12.2000, p. 19

 

E. Prace doktorskie i habilitacyjne

 

1.       M. Wierzbowska.
Ab initio Calculations for the Adsorption of Oxygen and Potassium on the Cr2O3(0001) Surface. Praca doktorska, KMK UMK, Toruń 1999, obrona czerwiec 2000

2.       N. Jankowski,
Ontogeniczne sieci neuronowe w zastosowaniu do klasyfikacji danych medycznych.
Praca doktorska, KMK UMK, Toruń 1999
obrona odbyła się w marcu 2000 przed Radą Naukową Instytutu Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej PAN, praca została wyróżniona

 

F. Prace magisterskie

1.       G. Stawski, Probabilistyczne miary odległości, sieci neuronowe i cechy symboliczne.
(KMK UMK, Toruń 6/2000)

 

Udział w konferencjach naukowych pracowników KMK UMK

 

Referaty zaproszone, sesje specjalne, panele dyskusyjne, tutoriale

 

1.       Duch W, Integracyjne mechanizmy kory mózgowej, VII Wiosenna Szkoła Neurobiologii Polskiego Towarzystwa Badań Układu Nerwowego (PTBUN), Warszawa 5.05.2000.
Ref. zaproszony, Consciousness and the dynamic models of the brain.

2.       Duch W, Sympozjum kognitywne „Subiektywność a świadomość", Obrzycko k. Poznania, 4-6 Maj 2000. Ref. zaproszony „Kognitywna Teoria Świadomości”.

3.       Duch W, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000  (członek komitetu naukowego); wykład specjalny „Jak działa mózg”.

4.       Duch W, Adamczak R, Grąbczewski K, Grudziński K, Jankowski N, Naud A, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000, tutorial: “Understanding the data”.

5.       Duch W, Intelligent Information Systems IX, Bystra, Poland, 12-16.06.2000.
Jak działa mózg? (wykład specjalny)

6.       Duch W, International Symposium on Computational Intelligence, Kosice, Slovakia 30.08-01.09.2000, referat plenarny: Computational intelligence methods and data understanding

7.       Duch W, XXIX Ogólnopolska Konferencja Zastosowań Matematyki, Zakopane, 25.09.2000, referat zaproszony: Metody inteligencji obliczeniowej oceniające podobieństwo do wzorców.

8.       Duch W, Medical Informatics and Technologies, Ustroń 8-10.11.2000; 
referat plenarny: Therapeutic implications of computer models of brain activity.

9.       Duch W, International Conference on Neural Information Processing ICONIP'2000, Dae-jon, Korea 13-18.11.2000, tutorial: Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods. (2 godziny)

10.   Duch W, International Joint Conference on Neural Networks, IJCNN2000, Como, Italy, 24-27.07.2000, tutorial: Understanding the data: extraction, optimization and interpretation of logical rules. (4 godziny)

11.   Duch W, prowadzenie tutorialu „Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods”, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000.

12.   Duch W, Ogólnopolska Konferencja Kognitywna, Toruń, 8-9.12.2000,
Referat: Czas zamknąć Chiński Pokój.

 

Referaty zwykłe

 

1.       Adamczak R, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000. Neural networks for structure-activity relationship problems (z Duch W)

2.       Adamczak R, udział w tutorialu „Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods”, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000.

3.       Duch W, Intelligent Information Systems IX, Bystra, Poland, 12-16.06.2000.
Optimization and interpretation of rule-based classifiers. (z Grąbczewski K, Jankowski N, Adamczak R)

4.       Grąbczewski K, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000. The separability of split value criterion (z Duch W)

5.       Grąbczewski K, udział w tutorialu „Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods”, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000.

6.       Grudziński K, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000. Symbolic features in neural networks (z Duch W, Stawski G)

7.       Grudziński K, udział w tutorialu „Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods”, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000.

8.       Grudziński K, Intelligent Information Systems IX, Bystra, Poland, 12-16.06.2000.
SBL-PM: A Simple Algorithm for Selection of Reference Instances for Similarity Based Methods (z Duch W)

9.       Jankowski N, International Join Conference on Neural Networks (IJCNN), 22-27.07.2000, Włochy, poster: Taxonomy of neural transfer functions.

10.   Jankowski N, 4th International Seminar on Statistics and Clinical Practice, 26-20.06.2000, Warsaw. Simultaneous differential diagnoses basing on MMPI inventory using neural networks and decision trees methods. (z Gomuła J)

11.   Jankowski N, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000
Data regularization.

12.   Jankowski N, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000
Probabilistic intervals of confidence.

13.   Jankowski N, udział w tutorialu „Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods”, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000.

14.   Jankowski N, Konferencja kierowników grantów KBN w Informatyce, 8-12 grudnia 2000, Zakopane, Polska, referat: Teoria i zastosowania metod inteligencji obliczeniowej.

15.   Naud A, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000
Referat: Interactive data exploration using MDS mapping  (z Duch W)

16.   Naud A, udział w tutorialu „Extraction of knowledge from data using Computational Intelligence methods”, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06.2000.

17.   Naud A, 4th International Seminar on Statistics and Clinical Practice, 26-20.06.2000, Warsaw.
Poster: Interactive data exploration with MDS (z Duch W)

18.   Naud A, Actes des 10emes Journées Neurosciences et sciences de l'Ingénieur - NSI'2000, pp. 89-92, 11-14.09.2000, Dinard, France.
Referat i poster: Exploration interactive de données par "Multidimensional scaling". (z Duch W)

19.   Meller J, From Genes to Proteins and to Biological Functions: Computational Approaches.
Referat: Design of an Efficient and Accurate Threading Algorithm: From Optimization of Energy Functions to Discovery of Structural Similarity of a Human RAS and a New Class of Plant Regulatory Genes, Ithaca, USA, Oct 2000.

20.   Meller J, Critical Assessment of Protein Structure Prediction 4, Asilomar, USA, Dec 2000

Udział w konferencjach z referatem przedstawianym przez współautora

1.       Adamczak R, Intelligent Information Systems IX, Bystra 12-16.06.2000, referat z: Duch W

2.       Grąbczewski K, Intelligent Information Systems IX, Bystra 12-16.06.2000, referat z: Duch W

3.       Jankowski N, Intelligent Information Systems IX, Bystra 12-16.06.2000, referat z: Duch W

Udział w konferencjach i szkołach (bez referatów)

1.       Meller J, Computational Challenges in the Post-Genomic Era, San Francisco, USA, May 2000

 

Udział w komitetach programowych i organizacyjnych konferencji

 

1.       Duch W, 8th European Symposium on Artificial Neural Networks, ESANN'2000, Brugge, 23-26 April 2000, członek komitetu naukowego.

2.       Duch W, 6th Engineering Applications of Neural Networks, EANN 2000, Kingston upon Thames, 17-19.07.2000, członek komitetu naukowego.

3.       Duch W, International Symposium on Computational Intelligence, Kosice, Slovakia 30.08-01.09.2000; członek komitetu naukowego, wykład plenarny: Computational intelligence methods and data understanding.

4.       Duch W, IEEE International Conference on Industrial Electronics, Control and Instrumentation - 21st Century Technologies and Industrial Opportunities, Nagoya Congress Center, Nagoya, Japan 22- 28.10.2000; 
członek Technical Program Committee, Emerging Technologies

5.       Duch W, Colloquia in Artificial Intelligence CAI'2000 Łódź, 5-7.10.2000, członek komitetu naukowego.

6.       Duch W, V Krajowa Konferencja "Modelowanie cybernetyczne systemów biologicznych", Kraków 19-20.05.2000, członek komitetu naukowego.

7.       Duch W, 5th Conference on Neural Networks and Soft Computing, Zakopane 5-10.06, członek komitetu naukowego.

8.       Duch W, Medical Informatics and Technologies, Ustroń 8-10.11.2000
Członek komitetu naukowego, wykład plenarny “Therapeutic implications of computer models of brain activity’.

9.       W. Duch, zaproszenie do komitetu naukowego najważniejszej europejskiej konferencji sieci neuronowych, ICANN, Wiedeń 2001

 

Referaty i wykłady na zaproszenie (poza konferencjami)

 

1.       Duch W (2000) Tokyo University, Tokyo, Japan,
How does the brain work (Prof. K. Yamanouchi)

2.       Duch W (2000) Brain Science Institute, RIKEN, Wako-shi, Saitama, Japan, 28.04.2000
Understanding the data: extraction, optimization and interpretation of logical rules. (Prof. Amari/Cichocki)

3.       Duch W, University of Konstanz, Germany, 20.07.2000
Neurophilosophical solution to the hard problem of consciousness.

4.       Duch W (2000) Międzynarodowe Towarzystwa Układów Otwartych i Dynamiki Informacyjnej, Toruń, Koncepcja duszy i umysłu w świetle neurobiologii.

5.       Duch W (2000) Instytut Fizyki UMK, Toruń.
Czy można zrobić świadomy komputer?

6.       Duch W (2000) Międzynarodowe Towarzystwa Układów Otwartych i Dynamiki Informacyjnej, Toruń. Komentarz do wykładu "Modelowanie cybernetyczne systemów biologicznych" prof. R. Tadeusiewicza.

7.       Duch W (2000) Koncert Orkiestry Kameralnej, Toruń 20.05.2000
Czy umysł może zrozumieć sam siebie? Uwagi o percepcji muzyki.

8.       Duch W (2000) Trzeci Festiwal Nauki, Wrocław, 23.09.2000
Sztuczny mózg? Sztuczna inteligencja? Dyskusja o postępach na drodze do sztucznej inteligencji.

9.       Duch W (2000) Zahcon 2000, Konwent Miłośników Fantastyki, Toruń, 7.10.2000
Cyberprzyszłość naprawdę fantastyczna. Rozważania futurologiczne.

10.   Grudziński K,
The Object Oriented Approach to Computing Based on Interactive Model Combination and Mixing, IF UMK, 2000

11.   Meller J, University of California San Francisco, USA, 15.05.2000,
The design of an efficient and accurate threading algorithm: Choice of energies and statistical verifications. (Prof. Cohen)

12.   Meller J, Rockefeller University, New York, USA, 27.06.2000
Computer-aided shortcuts on pathways from genes to drugs.

13.   Meller J, Computer-aided short cuts on pathways from genes to drugs, Cincinnati Children Hospital, USA, July 2000 (prof. B. Aaronow) 

14.   Meller J, Computational short cuts to protein structure and function: fold recognition methods. Cornell University, Ithaca, USA, Nov 2000 (Cornell Theory Center Workshop)

15.   Meller J, Locally Enhanced Sampling for molecular dynamimc and energy optimization. Cornell University, Ithaca, USA, Nov 2000 (Cornell Theory Center Workshop)

 

 

Staże i wyjazdy zagraniczne.

 

1.       Mgr Adamczak R, w Max Planck Inst. für Astrophysik, Garching, Niemcy, 20.10-20.12.2000(prof. Geerd H.F. Diercksen)

2.       Prof. W. Duch, Meiji University, Tokyo, Japonia (visiting professor, 3.04-3.05.2000)

3.       Prof.  Duch W, w Max Planck Institut für Astrophysik, Garching, Niemcy, 3.07-15.08.2000 (prof. Geerd H.F. Diercksen)

4.       Dr Meller J, Cornell University, od 1.1999, staż podoktorancki

 

Granty

 

1.       Duch W, 2000-2002, Teoria i zastosowania metod inteligencji obliczeniowej.
KBN, kierownik grantu.

2.       Duch W, 2000-2001, Zastosowanie systemu neurorozmytego FSM do analizy danych doświadczalnych (grant promotorski).

3.       Duch W, 2000-2001, Zastosowanie metod opartych na podobieństwie do analizy obrazów medycznych (grant promotorski).

4.       Duch W, 1999-2001 Similarity-based reasoning systems with applications in science and medicine. Współpraca Polsko-Niemiecka (BMBF-KBN), główny wykonawca po stronie polskiej.

5.       Duch W, Grant Fundacji Batorego, 35.000 zł, Szkolenie w zakresie wykorzystania INTERNETU w praktyce medycznej, 1998-2000 (kierownik grantu)

6.       Jankowski N, dofinansowanie kosztów konferencji International Joint Conference on Neural Networks, Como, Italy 2000 (grant Unii Europejskiej).


Pozostała działalność naukowa w 2000 roku

 

Prof. Włodzisław Duch:

 

1.       Powołany został na stanowisko profesora zwyczajnego 1.07.2000.

2.       W maju i październiku 2000 roku uczestniczył w panelu „Life Sciences” recenzującym w ramach 5 Programu Ramowego Unii Europejskiej program stypendiów Marie Curie.

3.       Był przez kolejny rok członkiem komitetu technicznego IEEE Neural Network Council, najważniejszej organizacji międzynarodowej skupiającej ekspertów w dziedzinie sieci neuronowych.

4.       Był członkiem Zespołu „Sieci Neuronowe i Logiki Rozmyte” komitetu Automatyki i Robotyki PAN, 1999-2002.

5.       Był członkiem zarządu Międzynarodowego Towarzystwa Układów Otwartych i Dynamiki Informacyjnej, kolejna kadencja 2000-2001

6.       Był członkiem zarządu Polskiego Towarzystwa Sieci Neuronowych, ponownie wybrany w czerwcu 2000 roku.

7.       Został wybrany na członka „Technical Program Committee member in the area of Emerging Technologies”, IEEE International Conference on Industrial Electronics, Control and Instrumentation - 21st Century Technologies and Industrial Opportunities,  Nagoya Congress Center, Nagoya, Japan 22- 28.10.2000.

8.       Został wybrany do Editorial Board pisma IEEE Transaction on Neural Networks, jako Books and Media Editor (2000 i 2001).

9.       Był członkiem rady redakcyjnej pisma „Computer Physics Communications” (Elsevier).

10.   Został zaproszony (styczeń 2000) do Journal of Computing and Information  Editorial Board

11.   Był przewodniczący rady naukowej nowego pisma „Kognitywistyka i media w edukacji” (Wyd. Adam Marszałek). W roku 2000 ukazał się trzeci numer tego pisma (ok. 300 stron). Jest to jedyne pismo w tej dziedzinie nauki w naszym kraju i w krajach Europy Centralnej.

12.   W 2000 roku był członkiem komitetów naukowych lub programowych 9 konferencji międzynarodowych.

13.   Napisał recenzję pracy habilitacyjnej z informatyki dr Jacka Mandziuka; kolokwium odbyło się w Instytucie Badań systemowych PAN, Warszawa.

14.   Był recenzentem pracy doktorskiej mgr Grzegorza Króliczaka z filozofii kognitywnej na UAM w Poznaniu.

15.   Był recenzentem pracy doktorskiej mgr Jacka Jelonka z informatyki na Politechnice Poznańskiej.

16.   W 2000 roku napisał recenzje prac dla takich pism jak Neural Networks, IEEE Transactions on Neural Networks, IEEE Transactions on Evolutionary Computations, Applied Mathematics and Computer Science, Neural Processing Letters, Computer Physics Communications, IEEE Transactions on Fuzzy Systems, Image and vision computing; Int. Journal Comp. Sci, Neurocomputing, 14 recenzji na międzynarodowe konferencje, 2 recenzje dla KBN, 3 recenzje wydawnicze dla WNT, Akademickiej Oficyny Wydawniczej i Wydawnictwa UMK.

17.   Był wykładowcą VII Wiosennej Szkoły Neurobiologii Polskiego Towarzystwa Badań Układu Nerwowego (PTBUN), „Integracyjne mechanizmy kory mózgowej”, Warszawa 5.05.2000
(wykład: Consciousness and the dynamic models of the brain).

18.   Brał czynny udział w organizacji konwersatorium kognitywnego, programu studiów w zakresie kognitywistyki i Centrum Nauk Kognitywnych na UMK.

19.   Zaproszony został do udziału w realizacji programu studiów doktoranckich Uniwersytetu Jagielońskiego w zakresie kognitywistyki.

20.   Uzyskał 3 granty KBN w sekcjach „Informatyka”, „Technika w medycynie” i „Metody Komputerowe w Nauce”.

21.   Na liście rankingowej sekcji „Informatyka” w dziale „Nowoczesne metodologie obliczeniowe” znalazł się na pierwszej pozycji.

22.   Wygłosił 3 tutoriale na międzynarodowych konferencjach.

23.   Kontynuował współpracę z firmą FQS Poland (Fujitsu Group) zainteresowaną programami do inteligentnego wspomagania podejmowania decyzji, analizy kwestionariuszy, zastosowaniem programów analizy danych diagnoz oraz projektem kognitywnych zabawek (wniosek patentowy W. Ducha z 1997 roku).

 

Dr Norbert Jankowski:

 

1.       Otrzymał wyróżnienie za prace doktorską od Rady Naukowej Instytutu Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej PAN w Warszawie (promotor – W. Duch)

2.       Awansował na stanowisko adiunkta.

 

Dr Jarosław Meller:

1.       Opracował program LOOPP, który bierze udział w ocenie metod automatycznych będąc sklasyfikowanym na jednym z czołowych miejsc w kategorii najtrudniejszych do przewidzenia struktur; jest to część struktury NIH. Program dostępny jest pod adresem
http://www.tc.cornell.edu/CBIO/loopp/

 

Profesor Jan Wasilewski:

 

1.       Kierownictwo pracy doktorskiej mgr M. Wierzbowskiej Oddziaływanie małych cząsteczek z powierzchniami kryształów jonowych. Praca została zakończona i uzyskała pozytywne recenzje. Obrona odbyła się 7.06.2000. Tytuł pracy: Ab initio Calculations for the Adsorption of Oxygen and Potassium on the Cr2O3(0001) Surface.

2.       Kierownictwo pracy doktorskiej mgr S. Zelka, Zastosowanie technik wielociałowych w teoretycznych badaniach oscylacji molekularnych. Ustalono szczegółowy plan i tytuł pracy: Teoria funkcjonałów gęstości i reprezentacja zmiennej dyskretnej w zastosowaniu do badania oscylacji molekularnych; praca jest przygotowana w ponad 50%

3.       Współkierownictwo seminarium naukowego Metody komputerowe w badaniach układów wieloatomowych, uczestniczą głównie doktoranci fizyki i chemii teoretycznej (prowadzone wspólnie z Wydziałem Chemii UMK)

4.       Koordynacja prac redakcyjnych nad Wydziałowym Informatorem ECTS - Studia na Wydziale Fizyki i Astronomii UMK w roku akademickim 1999/2000, ISBN 83-231-1081-6, str. 326, Wydawnictwo UMK, Toruń, 1999 (skład i łamanie: mgr H. Małłek z KMK)

5.       Referat na Wydziale Fizyki Politechniki Warszawskiej System studiów fizyki na Wydziale Fizyki i Astronomii UMK.

6.       Pełnił funkcję prodziekana ds. reformy studiów na Wydziale Fizyki i Astronomii.

 

Pracownicy i współpracownicy KMK w roku 2000

 

Katedra Metod Komputerowych ma obecnie (1.02.2001) 6 etatów naukowo-dydaktycznych (2 prof. nadzwyczajnego, 4 asystenta) oraz 2.5 etatu wykładowcy. Poniżej wymieniamy wszystkie osoby związane z KMK, włączając w to doktorantów, magistrantów i osoby będące na urlopie bezpłatnym.

 

Pracownicy na etatach naukowo-dydaktycznych

 

1.       Prof. dr hab. Włodzisław Duch, kierownik KMK (etat prof. nadzw.)

2.       dr hab. Jan Wasilewski, Prof. UMK  (etat prof. nadzw.)

3.       mgr Krzysztof Grąbczewski, asystent

4.       dr Norbert Jankowski, asystent

5.       inż Antoine Naud, asystent

6.       mgr Sławomir Zelek, asystent

Pracownicy na etatach wykładowców

7.       dr Feliks Maniakowski, starszy wykładowca

8.       mgr Halina Małłek, starszy wykładowca

9.       mgr inż. Andrzej  Korcala, 1/2 etatu wykładowcy

Pracownicy na urlopach bezpłatnych

10.   dr Jarosław Meller, adiunkt

Doktoranci

1.       mgr Małgorzata Wierzbowska, SD Fizyki od 6.01.95, obrona 6/2000 (prof. J. Wasilewski)

2.       mgr Rafał Adamczak, SD Fizyki, od 1.10.95 (prof. W. Duch)

3.       mgr Karol Grudziński, SD Fizyki, od 1.11.96 (prof. W. Duch)

 

Magistranci i licencjaci

10.     Sebastian Skrzynecki, fizyka komputerowa V, magistrant 2000-01 (prof. Duch)

11.     Maciej Orłowski, fizyka komputerowa V, magistrant 2000-01 (prof. Duch)

12.     Sławomir Soszyński, fizyka komputerowa V, magistrant 2000-01 (prof. Duch)

13.     Ryszard Jabczyński, fizyka komputerowa IV, magistrant 2000-01 (prof. Duch)

14.     Tomasz Winiarski, licencjat, 2000-01 (prof. Duch)

15.     Ewa Wieczorek, licencjat, 2000-01 (prof. Duch)